بادام خام بافت سخت و سفتی دارد که باعث می شود دیرتر و به سختی توسط سیستم گوارش هضم شود اما خیساندن بادام آن را نرم کرده و تجزیه و هضم آن راحت تر خواهد شد.
از سوی دیگر بادام دارای مواد ضد مغذی است که روی هضم و جذب مواد مورد نیاز بدن از جمله کلسیم، آهن، روی و منیزیم اثر منفی می گذارد در حالی که نتایج برخی تحقیقات نشان داده خیساندن بادام سطح مواد ضد مغذی موجود در غلات و حبوبات را کاهش می دهد، اگرچه شواهد کافی درباره اثر آن روی بادام و آجیل های درختی دیگر وجود ندارد.
در یک مطالعه مشخص شده خیساندن بادام به مدت 24 ساعت و در دمای اتاق به کاهش سطح اسید فیتیک آن کمک می کند. اسید فیتیک ترکیبی است که جذب مواد معدنی همچون آهن، روی و کلسیم را مختل کرده و ممکن است باعث کمبود مواد معدنی در بدن شود.